O Conquista F.C retomou suas atividades nesta temporada, após ter fechado as portas em 2000, sonhando com o acesso à elite do futebol baiano. Para isso, apostou em experientes ex-atletas da dupla BA-VI, caso do atacante Índio, ídolo do Vitória onde ficou conhecido como artilheiro das flechadas, além do meia Rogério Rios e do lateral-direito Carlos Alberto, esse último com passagens pelos dois clubes da capital.
Porém, o Conquista FC não conseguiu a tão sonhada vaga na elite do futebol baiano (que ficou com o Atlético de Alagoinhas) e terminou na quarta posição da Série B do Baiano, com 12 pontos. Apesar do acesso não ter vindo, o time conquistense teve boas atuações e chegou a liderar nas primeiras rodadas e brigar pela vaga na final, porém, da metade para o final, acumulou tropeços. Sem receber salários, os jogadores da equipe divulgaram uma nota cobrando do presidente Eduardo Mesquita os salários atrasados.